VISI
Menjadi Lembaga Dakwah dan Pendidikan Islam terkemuka dan modern dalam mencerahkan dan mencerdaskan kehidupan bangsa guna membentuk masyarakat Indonesia yang beriman, berilmu, beramal, dan bertaqwa menuju izzul Islam wal muslimin 

MISI
• Membina dan mengembangkan dakwah dan pendidikan Islam dalam arti yang seluar-luasnya dengan semangat amar makruf nahi munkar.  
• Mengawal dan membela aqidah Islamiyah berdasarkan Al-Qurân dan Sunnah Rasul.  
• Menegakkan nilai-nilai kemanusiaan sesuai ajaran Islam demi kesejahteraan umat dan bangsa lahir dan batin.
• Meningkatkan kualitas SDM guna mewujudkan masyarakat yang beriman, berilmu, beramal, dan bertaqwa melalui pengembangan kegiatan yang meningkatkan IMTAQ dan IPTEK sesuai aqidah Islam.
• Mendorong terwujudnya persatuan dan kesatuan umat untuk kesejahteraan seluruh rakyat Indonesia 

Pengembangan maryarakat dan persatuan umat untuk meningkatkan keimanan, ketaqwaaan, akhlak mulai dan kecerdasan umat serta tercapainya masyarakat adil makmur yang diridhai Allah SWT.

Berdirinya Masjid Raya Mujahidin dimulai dari adanya Kongres Muslimin Indonesia tahun 1953,dimana salah satu hasil kongres tersebut mencanangkan pembangunan Masjid  Raya di semua Kota di Indonesia. Beberapa delegasi dari Kalimantan Barat Muzanie A Ranie, Ahmad Mawardi Djafar, Abdul Rani Mahmud serta Rekan rekan kemudian membentuk Yayasan Mujahidin untuk merealisasikan rintisan pembangunan fisik Masjid Raya Mujahidin. Tepatnya pada tanggal 2 Oktober 1953.

Masjid Raya Mujahidin pada awalnya dibangun pada Tahun 1974 dengan nama Masjid
Mujahidin yang memiliki makna untuk mengenang perjuangan umat Islam didalam
kancah mengangkat Islam dan Jihad di Jalan Allah SWT.

Dibangun diatas lahan seluas 6,4 Ha dan diselesaikan empat tahun kemudian, diresmikan oleh Bapak H. Soeharto presiden 2 Republik Indonesia pada tanggal 23 Oktober 1978 Bertepatan 20 Dzulhijah 1398 H bersamaan
Hari jadi kota Pontianak yang ke 207.